任意の分岐した側鎖をもつタンパク質のコンフォーメーショナル・エネルギーの2次微分の並列アルゴリズム

島根大学理学部紀要 Volume 24 Page 139-148 published_at 1990-12-25
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File
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Title
任意の分岐した側鎖をもつタンパク質のコンフォーメーショナル・エネルギーの2次微分の並列アルゴリズム
Title
A Parallel Algorithm to Calculate Second Derivatives of Conformational Energy in Proteins with Any Branched Sidechains
Title Transcription
ニンイ ノ ブンキシタ ソクサ オ モツ タンパクシツ ノ コンフォーメーショナル エネルギー ノ 2ジ ビブン ノ ヘイレツ アルゴリズム
Creator
Hara Heihachiro
Kayano Takashi
Kanahiro Kazuhiko
Go Nobuhiro
Source Title
島根大学理学部紀要
Memoirs of the Faculty of Science, Shimane University
Volume 24
Start Page 139
End Page 148
Journal Identifire
ISSN 03879925
Descriptions
A protein molecule can be regarded as a set of rigid units and rotatable bonds. We present here a parallel algorithm of calculations for second derivative matrix with respect to dihedral angles around bonds for proteins with any branched side chains. The basic idea of the algorithm for processor array type computers is the introduction of the nearest outside units and related quantities. A method of initial setting and transfer of bond data is also presented in simple mathematical expressions which are easily coded in the computer program.
Language
eng
Resource Type departmental bulletin paper
Publisher
島根大学理学部
The Faculty of Science, Shimane University
Date of Issued 1990-12-25
Access Rights open access
Relation
[NCID] AN00108106